2010-01-01から1年間の記事一覧

遺伝子検査で思ってたここ3日くらいの胸のつかえが取れたかもしれない

2日前に書いていたんだけど、いろいろなタイミングで出さずじまいかと思いきや、はてブを読んでてやっぱり気持ち悪くて出そうと思い直した。 CheckDNA (アルクグループ) の一連でいろんな人がツィートしてて、「今回の件はよろしくない」という点でほとんど…

科研費の基盤と新学術の公募が出ていたよ

基盤 window.twttr = (function(d, s, id) { var js, fjs = d.getElementsByTagName(s)[0], t = window.twttr || {}; if (d.getElementById(id)) return t; js = d.createElement(s); js.id = id; js.src = "https://platform.twitter.com/widgets.js"; fjs.…

つらつらと Galaxy 関連の URL を貼るだけのエントリー

Galaxy の説明もしない俺得エントリー (?) Galaxy とは Galaxy: a comprehensive approach for supporting accessible, reproducible, and transparent computational research in the life sciences | Genome Biology | Full Text の論文を参照☆ http://blo…

NBA::GWAS Further Readings

# 9/20 少し追加 # 9/1 当日のスライドをエントリ最後に追加しました疾患の研究論文を読み漁ったので、ついでにブログに残してみる。 対象としたのは、GWAS (全ゲノム相関解析)、Missing Heritability (GWAS でつかめなかった遺伝寄与 = Missing heritabilit…

タクティクスオウガ、リメイクだなんて!!

タクティクスオウガ 運命の輪 特典 オリジナルタロットカード付き - PSP出版社/メーカー: スクウェア・エニックス発売日: 2010/11/11メディア: Video Game購入: 65人 クリック: 881回この商品を含むブログ (127件) を見る1995年にSFCで発売かー。これはまた…

おまけ

ただ今のタイミングでマジメな方の遺伝子テストサービスをきっちりと説明できる人は少ないと思う。現在進行形のせめぎ合いすぎる。あと2008年の人類遺伝学会の見解って見つからないんだけど…学会のサイトには収録されてないっぽいのが残念。

まだ玉石混淆の遺伝子検査

http://www.yomiuri.co.jp/national/news/20100813-OYT1T01215.htm がんやアルツハイマー病のリスクが分かるとするものや、子供の「才能」が分かるとうたうものまである。ただ、科学的根拠は必ずしも明確でなかったり、説明が十分でなかったりするものも多く…

遺伝子テストサービス (いわゆるDTC) 各社の簡単なまとめ

海外で遺伝子テストサービスの是非について議論沸騰しているけど、空気読まずに各社紹介とかやっちゃうよ! 背景 前回 Pathway Genomics社の遺伝子テストサービスを受けてみた - つぶやき〜 を書いてみたのは、個人的には万人にお勧めはできないですよー、と…

Pathway Genomics社の遺伝子テストサービスを受けてみた

結論から言うと、現状の遺伝子テストサービスは 疾患に関する遺伝研究の知識、または強い好奇心を持つ科学者 遺伝に興味のある医者 というような人以外には勧められない。 僕が個人的に勧めないってだけなんだけど、実際に自分で体験してみてそう考えた。こ…

.irbcrにもbegin-recue-endを書くと良いかも

などと今日ふと気付いた。というかハマった。 ということでこうした。.irbrcにbegin-rescue-endを書いているお手本を見かけ無いように思うので、一応ブログにしてみた。そんなのでハマるのが僕だけという可能性もあるが(・ε・)キニシナイ!! begin require 'rubyge…

20歳のときに知っておきたかったこと、を読んでみた

20歳のときに知っておきたかったこと スタンフォード大学集中講義作者: ティナ・シーリグ,Tina Seelig,高遠裕子出版社/メーカー: CCCメディアハウス発売日: 2010/03/10メディア: ハードカバー購入: 475人 クリック: 17,353回この商品を含むブログ (395件) を…

「ヒトの変異 人体の遺伝的多様性について」を読んだ

ヒトの変異体を豊富な資料と、それらを追求した科学者のことも含めて記載した一般書。 良書だったし、最後らへんにあった「ただ知りたい」という欲求に共感したのでメモして残しておく。 遺伝的な相違はあらゆる人々の間に存在する。ではどのような相違があ…

アホ・バカ分布図 (のようなもの)、Twitterだとだいぶラクに作れそうじゃね?

@hiroking1975さんのつぶやきから、エントリ名のことを思ったり。 夏休みかなんかの自由課題とかにどーだろう?こういった分布図に出来そうな思いつきをサクっと形に出来るサイトを構築でもいいかもしんない。 アホ・バカ分布図がなにか?というのはこちらで。

Personalized genomic information: preparing for the future of genetic medicine

Personalized genomic information: preparing for the future of genetic medicine がちょっとおもしろかった。4人のgenome/genetics/cancer領域の科学者が答えてる。 のっけから一人だけ意見を異にするKari Stefansson博士が気持ちいい。 リップサービスで…

助成金の報告会に参加してきた

今年度、自分のしている研究に民間財団から助成金を頂いていて、今日は全12名が集まっての成果報告会 (at 川越) だった。テーマがドンピシャだったのだろうけど、自分だけヒラ研究員であとはみんな教授という中で空気読まずにニコニコ成果報告してきましたよ…

SNP Effect predictor

Exome sequenceなどで多くのvariantsが見つかるのだけど、それらがタンパク質に与える影響を知りたい時にどうするか? PolyPhenがよく用いられてるっぽいけど、UCSCのMLでEnsemblにもSNP Effect predictorというツールが加わったらしいのを知ったのでメモ代わ…

GUIのR.appでラクに” <- ”を挿入したかったので、DefaultKeyBinding.dictでやってみたら出来た

Ctr+jで" OS X限定です。 DefaultKeyBinding.dictを設定するとCocoaアプリでキーコンビネーションの挙動を設定できるのですが、テキスト挿入も出来るんですね。 以下のようにDefaultKeyBinding.dictを作ってやるだけでした。 [mako@Akari](1.47) cat ~/Libra…

BioCのMLで"dbSNP - getting details of Pubmed ID for a SNP"というのがあったのでメモ

あるSNPが触れられている文献を「rsSNPidをクエリーにして、NCBI eUtilsでPubMed ID」をゲットする、というもの。 [BioC] dbSNP - getting details of Pubmed ID for a SNP Hi,I had a set of snp ids (e.g. 'rs11805303'). Is there any package that will …