2007-07-01から1ヶ月間の記事一覧

SNPassocを使ってみた

R

まだ計算中だけど‥100サンプル、1000 SNP で dominant/codominant/recessive のパターンを計算させるのに3分強って感じだった。2000 SNP で10分越したみたい。 25万 SNP なので、Ruby でざく切りして qsub に突っ込む。qsub ありがたや。 しかし、シェルが sh…

ドラクエ4~6がリメイク

されるんですね、DSで。任天堂、まだまだ株価維持?

なんかいろいろ

来るもの来るもの不確定要素を持っているから整理しようがないぞ。 バッサバッサ枝切りしていって、残った幹からスケジュールを整理していく。 みんな頼ってくれるのはいいけど、給料あげて、と思った今日。

学内グラント

出してみた。9月中頃に発表かな? どこまで書くのかさじ加減がさっぱり分からず苦戦した。

浴衣を見かける

今日は花火だねー、とツレが言う。なるほど。

昨日は学内シンポ

研究センターのシンポジウム。 良くある「ちょっと文字がきれてますけど‥」っていうのは、自分で作ってないからフォントずれで起きるわけだよな。 1個くらいならいいけど、連発されるとうなだれる。 ランチョンセミナーのお弁当はとても豪華だったらしい。 K…

僕の前世

強面のやさしい人だったらしい。 子犬にそっとエサをあげる不良みたいな。 ラボの妄想族*1が教えてくれた。 ありがとう:-) *1:字面どおりな人達w

7つの習慣、Delegate

昨日ボスと長々話した時に delegation のことを話してみた。 人に仕事を任せる(委譲する、翻訳本だとデレゲーション)ときには次の点を心がけるといいよね、という話題。 望む結果 出すべき結果について明確な相互理解を得る。「どうやって」ではなく「何を…

朝7:50

徒歩通。朝もやとかキレイだった:-) そろそろ梅雨明け?

MacFUSEとMacFusion入れてみた

OSX

=> http://www.sccs.swarthmore.edu/users/08/mgorbach/MacFusionWeb/ 今まで、 ssh経由でサーバーでRを走らせる 出力されたfigのファイルをローカルにコピー Preview.appで見る とかすることがあったが、Fuseでマウントしておけば 直接サーバーのファイルを…

朝7:30

時たまNiさんと朝に長話する。 感謝されたようだ。こちらこそありがとうでした。

朝7:30

今日は車。

LightCSVとFasterCSVの速度差はこんな感じだよ

[mako@akari]foreach i in lightcsv.rb fastercsv.rb echo $i /usr/bin/time ruby $i end lightcsv.rb 17.40 real 15.60 user 1.76 sys fastercsv.rb 21.31 real 18.73 user 2.53 sysFasterCSVってrequire 'faster_csv'なんだよね。 [mako@akari]cat fasterc…

セミナー

理研のH先生が来られてnoncoding RNAの話をされた。 大学4年生のときに自分の師匠だった人が取った遺伝子が登場。 シークエンスしたなぁ、ガラス磨いてw 聞いてて思ったのは2つの材料を結びつける着想が良かったこと。 どうしてそのポイントを思いついたのか…

Vista

人の移動に伴って、小規模なPCのリプレイス。 セットアップをNさんと2人で。 やれやれ。

朝8:00

日曜はさんざん寝たのに、今イチな寝起き。 徒歩。 体調いまいち。 カードキー忘れる。 財布も忘れる持っていた。 カードキー持たずに閉じ込められること3回。 ひさびさにリポD飲んでみた。 モノが届いた。 7月はいろいろあってタイト。 やせるかも!:-)

こういうことをすると

摩擦を生むこともあるって分かってるんだけど、言ってしまった。 どーでもいい人には、苦言を呈することはないんだけどね。 あまりにもひさびさで自分でも驚いた。 ここ最近は相方くらいにしか言った記憶がない。

届いたー

amazonへのリンクはまだないので。 RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス作者: R.ジェントルマン,V.J.カリー,W.フーバー,R.A.イリザリー,S.ドュドイト,荒川和晴,粕川雄也,川路英哉,河野信,神田将和,鈴木治夫,田中伸也,中尾光輝,長嶋剛史,二階堂…

ここ最近のこと

体重が一瞬だけど60kg台になった Nさんとのダイエットレースに敗北。何を食べにいきますかねー:-) 転職された、おめでとうございます 時たま来る、色々考える時期っぽい。自分のフィールドはどこだろう? そろそろ七夕。誘われた。嬉しい キャンプ誘われた。…

角島大橋

山口に帰った時に行く。 角島大橋 - Wikipedia