仕事

6月は

グラントを真面目に気にした初めての月だったなー。 まあいい経験になったので、今後に生きてくること請け合い。

SNPassoc が機能アップしていた

http://cran.r-project.org/src/contrib/Descriptions/SNPassoc.html あとで見る。 R Graphic Manuals の方が見やすい*1。 http://cged.genes.nig.ac.jp/RGM2/pkg.php?p=SNPassoc *1:というか CRAN の方はリンク切れしていたので。

aroma.affymetrix を入れてみる

まず EBImage を先立ってインストールしておく。 しかし ImageMagick が 6.2.6 くらいじゃないと蹴られる。 CentOS 4.1 に入れた時は ImageMagick の最新版を本家サイトからダウンロードしておいて # まずこっち yum -y install libjpeg-devel libpng-devel …

CNAT (Copy Number Analysis Tool) を入れてみる

CNAT 入れるには GTYPE4.1を先立って入れる必要があって、GTYPE 入れるには GCOS を先立って入れる必要があって、ダウンロードで過ぎていく午前9時。 そして別タスクが終わった頃に、GCOSを 入れようとすると、Windows の英語版にしかインスコできないという…

届いたー

amazonへのリンクはまだないので。 RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス作者: R.ジェントルマン,V.J.カリー,W.フーバー,R.A.イリザリー,S.ドュドイト,荒川和晴,粕川雄也,川路英哉,河野信,神田将和,鈴木治夫,田中伸也,中尾光輝,長嶋剛史,二階堂…

SNP Signal Tool

The SNP Signal Tool generates cluster drawings of SNP Signals, one drawing per SNP over a set of experiments. Each drawing consists of a set of points in "Contrast" vs. "Size" space. The points are colored according to the BRLMM-p genotype…

SNP 6.0 Probe Level Access Tool というのが出てる

SNP 6.0 Probe Level Access Tool (SPLAT) is research tool for customers who are investigating the use of SNP 6.0 for genome-wide copy number. SPLAT extracts probe intensities for collections of Genome-Wide SNP Array 6.0 CEL files. The softw…