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今まで-nで数値をソートしてたけど、-gのがいいじゃないか！ -g, --general-numeric-sort compare according to general numerical value -n, --numeric-sort compare according to string numerical valuegオプションを使うと「e-05」とかも望み通りソート…
A. Table browserのintersectionの機能を使えばいいよというやりとりがUCSCのMLにあったのでメモっておく。 Table browserはEnsemblのBioMartのようなもの。 BioMartがどういうものかはググってね。 自分ではやらないのだが、やっている同僚へのメールついで…
http://www.biomethod.jp/omics/ プログラムはこちら http://www.biomethod.jp/omics/program.html
2-3時間ほど仕事していたのだけど、RSSとかも見ることなくサクサクと仕事が進んで気持ちいい。 普段と違うから、緊張したのかは分からないけど、集中出来たのは確か。 必要最低限のもの（MBPと紙とペン）しか持っていかなかったから、余計な物が視界に入らな…
echo 'data hoge.txt");source("hoge.r")' | R --slave --vanilla うーん、使う場面あるのか？忘れそうだけど、ひょっとしたら使うかもしれないからメモしとく。 hoge.rが処理本体部分。
ただ長く細かくずらずらと書いていれば、相手が分かってくれるわけではない。 メールで長文を書く人は、そこのところを分かってほしい。 これは分かりやすいスライドを作る能力とかなり近いところにある。 良い点、悪い点を簡潔なリストにして「見える化」す…
ある遺伝子でどのSNPをタイピングすればいーの？って時に使えるかも。 メモ代わりなので今のところ使ってません。内容不正確。 http://www.pupasnp.org http://fastsnp.ibms.sinica.edu.tw/pages/input_CandidateGeneSearch.jsp http://snpnavigator.net/
うちはTR（トランスレーショナルリサーチ）部門といって、医局の先生方との共同研究がメイン。 で僕が春からこっちに来て、関わったものの1つが終わったのでテック2人とプロジェクトふりかえりをしてみた。 結論から言うと、それぞれの立場の違いから思って…
UCSCだとここ。 http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTracks?chromInfoPage= http://genome.ucsc.edu/goldenPath/stats.html#hg17
いろいろと小技を使うと、制約に沿ってないテーブルにも使えることを今日知る。。 備忘録代わりにメモ。 http://techno.hippy.jp/rorwiki/?HowToUseLegacySchemas http://wiki.fdiary.net/rails/?ActiveRecord -http://jp.rubyist.net/magazine/?0006-RubyOn…
ensemblの呼び分けを知らなかったので、記述を探した。以下にあった。 lftp ftp.ensembl.org:/pub/current_homo_sapiens/data/fasta/cdna> less README
シーケンサーのデータが溜まってきたので、アクションした。 http://itoshi.tv/d/?date=20060203#p02 を見て真似する。cronとrsync (ssh)の組み合わせ。 慣れないCygwinでハマったのが2点。 1. vimを入れていないとcrontab -eが動かない これはエラー表示でv…
いちいちgmailにアクセスするのが面倒なので #!/bin/sh # 初期設定(メール送信宛先、件名) address="ma.kohda_at_gmail.com" subject="$@" # 件名の文字コードをutf8に変換 subject=`echo $subject | nkf -w` echo $subject # メール送信 mail -s "$subject"…
（書きかけ） 所属してる部門の仕事は平行して走るのだけど、新参な私には把握しづらいこと山の如しなのでGantt chartが描けるものを探してみた。 http://japan.linux.com/desktop/05/08/22/030221.shtmlとりあえずGantt Projectが使いやすそうなので試用中。
クイックツアー。
10/17〜10/20で鳥取県は米子市にてw http://www.convention-j.com/jshg51/index.html
同僚がprimer3をイジイジしてるのを見たのとid:h-kondoさんもコンパイルに問題があったようなのでトライしてみた。ちなみにid:h-kondoさんのところからOSXのバイナリ版が辿れるのでそっち使う方が良い。 こっちはただの備忘録程度。 普通に http://frodo.wi.…
読んでも分からなかったので質問したいな〜、と思いつつググってみても見つけられない‥orz 困って出版社にメールを出すも個人情報の観点から教えられないとのこと（当然だよね）。 ところがN山書店の対応してくれた方が親切にいろいろ対応してくれてメルアド…
もう木曜だし、ないのかと思っていたら‥この不意打ち‥orz 日々、力不足を感じつつも仕事するのが楽しい毎日です :D Webの方も更新して頂いてます。 これからも頑張っていきますので、皆様よろしく御願いいたします。
午前中に2人から「入れた？」と声をかけられるヒトバシラー。変わった職場w さらにWin XP (SP2)のインストールCDが一個余っていたのを出してくれた。 やりたいけど、時間がなかなか作れない。 うちに帰って楽しくインストールを試みるも、ファームウェアアッ…
http://www.yodosha.co.jp/book/4897064953.html 早速注文。まずはAmazonの住所を変更するとこからか。=> した＆注文した。 統計遺伝学のソフトは単体で動かないものが多いのかな？ あるソフトAの入力ファイルを作るのにソフトBがいったりという感じ。 シミ…
MacBookProで気になるのは熱かな〜。左手小指があったかい。 遅く感じることはない（2.16GHzと今知った）。 今finkいじいじ。
ゆるふわな髪型のメンターが用意しておいてくれた2台（MacBookProとLet's note）の設定だけで日が暮れた。。
うへー、やっぱりスタートは緊張っていうか不安ある。 が、楽しめるし頑張れる :D 行ってきまーす。 => 車で1時間かかった‥orz
プレスが出てますね。 とにかくみなさんお疲れ様でした。
# 基本的にMac OS X(10.4)再セットアップの手順 http://itoshi.tv/d/?date=20060130#p02 を参考にして行った # Thanx > 公開を快く承諾してくれたichan氏 プリンタを設定する OSの設定 1. X11を入れ忘れないようにいれる。 => 忘れた‥orz => 対策：http://d.…
fink install findutils # find . -size +4M -print とか出来る そのうちセットアップをしなければいけないので参考になるところを。 itoshi氏 http://itoshi.tv/d/?date=20060130#p02 id:sesejun氏 http://lab.se-se.jp/bioinfo/wiki/index.php?BioinfoLect…
あいにく今週埋まり気味なので新職場には行けそうにない…ゴメンねorz インストール時のメモを忘れないようにしないとね。。 また別に「○○の動作確認してよ」のコメントがあればやってみようと思います*1。 需要あるそうなので、気軽にコメントに書いて頂けれ…
うっかりしてタスクリストを家に持って帰ったまま置いてきてしまった‥orz 何をするべきかが書いてあったものだけに、何をすればいいのかが鮮明に思い出せない僕がいますw 持って帰るならコピーがいるかな、これは。
2時間半ってところか‥orz カプセルホテル泊まって2日に1回帰るって方針のが良かったな。 持ってきた本がつまらなくって、急遽手帳にメモして考え事。 最近、ほぼ日手帳の赤色が欲しくてたまらない。
