2008-01-01から1年間の記事一覧

本以外では

200ばかり家系図を眺めつつピックアップ。 こういった遺伝性疾患の家系リソースっていろいろあるのかもしれないが、おそらくほぼ宣伝されてないんだろうな。 もちろんその分野の人は知ってるんだろうけど、実際には分野を超えて研究するためにはより宣伝を。…

先週、科博に行ったついでに

今更ながらいくつかヒトゲノムにまつわる本を乱読した(している)ところ。 ヒトゲノムのゆくえ、がおもしろかった。 ヒトゲノムにまつわる当時の世界の動きをジョン・サルストン博士が描いている。 日本のことはほとんど取り上げられていないので、日本はど…

どうなることかと思っていたが

仲良く2人で行って来たことも報告しておくワン。

行けなかったけど

偶然にもこの日の午前中はサイエンスコミュニケーター養成実践講座というのがあったらしい。 http://www.kahaku.go.jp/news/2008/20080223.htmlTwitter 経由で教えてくれた wakataka_423 さんは行ったようだ。なかなかの内容だったみたいでうらやましかった…

国立科学博物館の「 DNA の先へ」を見に行って来た

ミニコーナーなので、展示パネルが5つくらいだけど、そのわりには楽しめたよ。 ただこれはシーケンスを知ってる人なら、だろう。 RISA*1 とサンガー法の説明がメイン。初めて2回も同じ分野でノーベル賞を取ったのがサンガー卿です。 昔、ジャンプでノーベル…

Twitter リンク集はどこにあるのか

つぃったー部にあったのか。 便利なBOT - TwitterまとめWiki ついったーで発見 - はてなグループ::ついったー部 検索はこちら。他にもあるっぽいね。 http://twitter.1x1.jp/search/

うーん、http://twitter.com/sevent が何気にいい(期待を込めて)

Twitter してるバイオな人にもお勧めです。どんなアカウントかというと、 みんなでイベント情報を共有するためのコダマ系アカウントです。みんなにお知らせしたいイベント情報があれば、@seventにその内容をリプライして下さい。そうすると@seventのFollower…

Incorrect genomic position for merged SNPs in release #23 data files

ダウンロードしていた人はし直しておきましょう。 [HapMap announcements] incorrect genomic position for merged SNPs in release #23 data filesThis message is to inform you that the position of ~24,500 SNPs was inadvertently entered incorrectly…

うーん、何気に http://twitter.com/nikkei_btj がいい

Twitter してるバイオな人にお勧めです。日経BTJの最新ニュースが twitter で適当に読めますw 1時間で1000億塩基読める、米PacBio社が2010年製品化を発表したDNAシーケンサーが2月19日のゲノムネットワークシンポでも話題に http://tinyurl.com/2w9ds7 とか…

左後ろから「ドンッ」という音とともにエラー

Car

エラーメッセージ読み取れず。もっと読みやすいフォントにしてw レッカーが来るまで優雅に読書して過ごすも、外に立ちっぱなしだったので体温が下がった。

aroma.affymetrix で 250K Nsp array を 240枚ほどかけてみて

50時間経った今、66枚ほどは終わったみたい。 Linux で走る良いツールがあったら教えて下さい:-)

BioC の ML で

[BioC] Trouble installing bioconductor packages on 64 bit R on OS X Leopard というのが興味あったのでメモ。

The Ultimate List of RubyCocoa Tutorials, Tips and Tools がスゴい

http://www.rubyinside.com/the-ultimate-list-of-rubycocoa-tutorials-tips-and-tools-728.html これは良いまとめ。 うちの http://d.hatena.ne.jp/ma_ko/20071218#p1 をインスパイアということだけれど、良くまとまってるな〜。 しかも知らないのもちらほ…

百式企画塾:カレンダー++を考える

年末年始になにかともらうカレンダー。しかし、「こんなにカレンダーあってもなぁ・・・」となってしまう人も多いのでは。そこであなたは「絶対に使ってもらえるカレンダー」を考えつきました。2009年のカレンダーのデファクトとなったその特徴的なカレンダ…

HapMap さあ

それよりも release 22 の ld データは? ただただ途方も無い量のデータを出すだけじゃなくて、きちんとユーザーが使いやすい形にもして欲しい。 データを使いたい人は多くても、あれだけのデータを気軽に加工できる研究者は限られるだろうに。でも release …

Rubyで pdf から text 抽出してみる

ところが寝る前に HMDT3版を読んでいたら RubyCocoa*1 で pdf からの text 抽出が載っていた ので、ちょっと Nature とかの pdf から text 抽出して doi を抜き出せるか試してみた。 #!/usr/bin/env ruby # # Created by mako on 2008-01-29. # What? # This…

ってどうやるの?

文献管理ソフトは、pdf ファイルの名前を pmid.pdf にするのが多そうだけど、手作業はめんどい。 => 誰か変換スクリプトを〜。 => ktkr http://www.geocities.jp/researcherinus/perl1 => うまく text 抽出できない場合がある => 自分で書けないもんだろうか…

読みかけだけど、ワインバーグの文章読本はなかなかおもしろい

自然石構築法はユビキタスキャプチャーとアイデアマラソンを足して割った感じ。 #僕が3者とも正確に理解しているか保証は出来ないけど:-(普段自分が過ごす時間の中で、どうネタの原石を見つけるか、その原石をどう形あるものに持っていくか。 そんな本みたい…

なんか Load Avg. が高い

これだと1.30だけど1.0付近を何にもしてなくてもうろついてるような‥なぜ? CPU 全然使ってないし、負荷がかかってないのに高くなるって??

書きかけ、Cocoa 雑多メモ、自分用、後で整理、Cocoa の framework とか Core Graphics 等のメモ

Matt Legend Gemmell : Cocoa Source Code http://mattgemmell.com/source たくさん。HUDWindow とか。使い方サンプルって感じか? Vacuous Virtuoso: The ultimate Core Graphics resource http://lipidity.com/apple/the-ultimate-core-graphics-resource …

Ruby や Rails で使う gruff のx軸ラベルを斜めとかにしたい場合ない?

実行結果はこんな感じ。 もしこれデフォルトで出来るんだったら、恥ずかしながら知らない‥。http://techlists.org/archives/programming/railslist/2006-07/msg01829.shtml にコードがある。 ただ自分が試した限りは上のリンク先のコードを一部削らないと動…

C3 音沙汰なし

car

車無し生活。朝は歩きで帰りはバス。 そろそろ C3 が恋しい。

fixdap 経由で

id:faultier さんが CoreData を用いた twitter クライアントの習作を作っていた。 素晴らしいー。続きに勝手に期待です。 http://d.hatena.ne.jp/faultier/20080102/1199242595 CoreData が何なのかもリンク先にやさしく書いてある。 今のところ書籍として…

RubyCocoa で Ruby/twitter ライブラリに GUI を付けてみた

とりあえず何かに GUI を被せることから始めるのが簡単そうだったのでやってみた。 RubyCocoa 入門を2度ほどやってみて、なんとなく理解した。 sender が何なのか分かりづらい場合は p senderでクラスを見てやると良いかも。 Interface Builder での delegat…

Consed News for Solexa, 454, and Macosx users なんていうのが来ていた

ユーザー全員にいってるんだろうけど、一部転載。 There is Consed news for Solexa and 454 users and macosx users:1) I am now actively working on Consed to handle large numbers of Solexa and 454 reads. Stay tuned for details.2) There is a new …

ANTIPOLLUTION FAULT

car

エンジン始動時にセンターディスプレイに表示された。 ついでにメーター下部にあるエンジンマークも点灯(安全チェックをパス出来なかったから)。 エンジン切って、マニュアルをめくってみるが、エンジンマーク点灯は修理行きっぽい => 初のアシタントサー…

gem で opencv 関連を OSX にインスコした時の中途半端な覚え書き(失敗記録)

このエントリーは gem をまったく使いこなせていない自分が無理矢理インスコした時の記録 + 次回はよりスマートに行う為の自分へのメモです。。 Ruby/OpenCV って OSX でも動くのかな?ウィンドウが生成された時にエラーで落ちるけど。 まず gem install に…