Bioconductor installation problem on Mac
BioCのMLからクリップ。自分も困りそうだから :-)
質問者はR version 2.3.1, on Mac (OS 10.4.7, on an Intel CoreDuo iMac) とのこと。
次のwarningがでるらしい。
The downloaded packages are in /tmp/RtmpJdBYlA/downloaded_packages Warning messages: 1: number of rows of result is not a multiple of vector length (arg 2) in: cbind(1, res0, Repository = repos) 2: cannot create HTML package index in: make.packages.html()
最初のものは、次のようなことらしい。
The first warning occurs when an empty package repository is in place in BioC, usually because a package had errors in testing and did not compile. This is reportedly fixed in the upcoming release of R, but not in the current release.
2番目については
If you run > help.start() before you run > source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite(c("affy"))
でOKのようだ。
いずれ入れ直しそうだから、ここにメモる。
intelマカーの為にもメモる。